G·01Нуклеосинтез: откуда берётся вещество ⛓

Водород родился в Первые три минуты после Большого взрыва. Углерод — в горении гелия внутри звёзд. Кислород — от горения гелия и углерода. Азот — в CNO-цикле, где он работает катализатором и не расходуется. Фосфор — от горения кислорода и неона, самый поздний и редкий из пяти.

Порядок рождения элементов не совпадает с порядком их места в модели: водород родился первым, но его категория стоит седьмой, последней.

stellar nucleosynthesis CNO cycletriple alpha process carbonphosphorus cosmic abundance originoxygen burning silicon burning supernovar-process neutron star merger

Планируется карточек: 8–12 · источники: arXiv astro-ph, Annual Review of Astronomy, Nature Astronomy

Разбор для читателя: Нуклеосинтез: как в звёздах рождаются элементы

G·02Кислородная катастрофа ⛓

Два с половиной миллиарда лет назад доступность металлов на Планете изменилась необратимо. До катастрофы были доступны железо, марганец, кобальт, никель. После — медь, цинк, молибден, селен. Граница совпадает с максимумом ряда Ирвинга-Уильямса — порядка, по которому металлы связываются с белками. Семьдесят веществ, из которых построена жизнь, были отобраны из того, что стало доступно после глобальной химической перестройки атмосферы.

great oxidation event trace metal bioavailabilityIrving-Williams series metal selection biologymetalloprotein evolution oxygen atmosphere

Планируется карточек: 5–7

Разбор для читателя: Кислородная катастрофа

G·03Фосфор как переключатель ⛓

Киназа вешает метку, фосфатаза снимает. Метка не делает работу — она её адресует. АТФ активна только как комплекс с магнием. Фосфатазы — цинковые металлоферменты. Эта тема изучена глубже всего остального в каталоге — сотни работ, приоритет отдаётся обзорам.

protein phosphorylation switch kinase phosphatasephosphate molecular tag signalingSH2 domain phosphotyrosine dockingtopoisomerase phosphotyrosine covalent intermediate

Планируется карточек: 15–20 · смежная тема: весь раздел P

Разбор для читателя: Фосфор: элемент, который ставит метку

G·04Система меток ⛓

Фосфат означает «это моё». Убиквитин означает «это убрать». Метилирование означает «эту копию молчать». Окисление цистеина означает «эту фосфатазу выключить». Убиквитиновый код: присоединение по K48 даёт деградацию, по K63 — сигналинг, по M1 — активацию NF-κB. Одна и та же молекула, но смысл определяется точкой пришивки, а не самим фактом присоединения.

ubiquitin code K48 K63 linkage specificitypost-translational modification codeDNA methylation gene silencingcysteine oxidation phosphatase redox

Планируется карточек: 10–12

Разбор для читателя: Метка: механизм принадлежности

G·05Аллостаз

Организм не реагирует на происходящее, а исполняет предсказание. Здоровье в этой модели есть оптимальное предиктивное колебание, а не статичное равновесие. Гипертония и ожирение в таком прочтении возникают из трудности найти подходящий ритм, а не из одной сломанной связи.

allostasis predictive regulation Sterlingallostatic load McEwen four typesinteroceptive predictive coding Barrettallostatic-interoceptive overload

Планируется карточек: 12–15 · обязательно включить метаанализ по когнитивным функциям (18 работ)

Разбор для читателя: Почему симптом возвращается

G·06Эмоция как предсказание

В современной теории конструирования эмоции не считываются как готовые категории, а собираются заново каждый раз. Базовый уровень — аффект: валентность (приятно/неприятно) и активация (сильно/слабо). Названия эмоций культурно заданы, поэтому привязывать конкретный химический элемент к конкретному названию эмоции методологически некорректно.

theory of constructed emotion Barrettcore affect valence arousal interoceptionbodily maps of emotions Nummenmaaemotion granularity health outcomesalexithymia interoceptive accuracy

Планируется карточек: 8–10 · обязательно включить Nummenmaa, PNAS 2014, n=701

G·07Китайская медицина и молекулярная биология ⚠

При синдромах холода в традиционной классификации преобладают гормональные показатели, при синдромах жара — иммунные факторы, и оба связаны нейромедиаторами. Найдены конкретные биомаркеры: CCL2 коррелирует с картиной жара, лептин — с картиной холода.

TCM network pharmacology ZHENG syndromecold hot syndrome transcriptomicsspleen qi deficiency biological basissame syndrome different diseases molecular

Планируется карточек: 6–8